Кольцо стен окружало пригороды Бухары в 16 веке при Абд ал-Азиз-хане I (1540-1549 г.г.). Исследователями установлены названия одиннадцати городских ворот, из которых пять размещались на сохранившемся участке. Уцелели только ворота именно конца XVI в. - Талипач на севере, Каракуль – на юго-западе. Южные ворота Шейх Джалал полностью разрушены уже в наши дни.

Средневековая Бухара — феномен искусства зодчих. XVI—XVII вв, особенно начало XVI в., были неспокойным временем неустойчивой власти первых ханов династии Шайбанидов и переноса столицы попеременно из Самарканда в Бухару

Исследователями установлены названия одиннадцати городских ворот, из которых пять, размещались на сохранившемся участке. Уцелели только ворота конца XVI в. — Талипач на севере, Каракуль — на юго-западе и буквально на глазах, в наши дни утраченные — Шейх Джалал на юге.

Мавзолей Буян-Кули-хана (Буян-Кули-хана Мавзолей) был возведен на территории селения Фатхабад, которое впоследствии вошло в черту города, к востоку от средневекового города Бухара, находился обширный культовый комплекс, расположенный у могилы популярного шейха, поэта и богослова, Сайф ад-Дина Бохарзи (на карте Сайф ад-Дин Бохарзи Мавзолей), жившего в 1190—1261 г.г. Целый квартал рабада (рабад – предместье города) здесь занимали ханаки (ханака - общежития для дервишей), в которых дервиши жили на средства, пожертвованные членами общины ордена Кубрави. Рядом с почитаемым захоронением аль-Бохарзи в 1358 г.

Загородный дворец Ситораи Мохи-хоса расположен в 4-х километрах к северу от Бухары. Строительство дворца было начато в конце 19 века, когда по распоряжению эмира Ахадхана лучшие бухарские мастера были направлены в Россию (Петербург и Ялту) для изучения там опыта русских зодчих. Поэтому ансамбль представляет собой смесь европейской архитектуры с архитектурой дворцов Исфагана и богатых жилых домов Бухары.

Большой интерес вызывают крепостные стены и ворота Бухары. Часть городской стены Бухары с огромными проломами – уникальный памятник оборонной архитектуры Узбекистана, важное звено исторической топографии города. Как сообщает автор «Истории Бухары» Наршахи (Х в.), первые стены шахристана были возведены еще в VIII веке, во время правления Тахиридов.

Ляби-Хауз (Ляби-Хауз Ансамбль). Ляби-Хауз (фарси "берег", букв. "губа водоёма", или "побережье пруда" ) это название территории, которая окружает один из немногих сохранившихся до наших дней прудов (хаузов) в Бухаре. До установления Советской власти в Бухаре было много подобных прудов, которые служили источниками воды для жителей города. Но у прудов была дурная слава, так как они являются распространителями болезней. Поэтому по большей части хаузы постепенно были осушены в период 1920 - 30 гг. Ляби-Хауз уцелел из-за того, что он является центром великолепного архитектурного ансамбля, который создавался в течении 16 и 17 веков, и который почти не изменился с тех пор.

Квартал с одноименным названием Гозиён («борцы за веру») был одним из центров мусульманского образования в дореволюционной Бухаре. Здесь находилось несколько медресе. Самым крупным, в котором вплоть до революции читались лекции, было медресе Мулло Мухаммад-Шариф, построенное, в начале XIX в.

На подходе торговой улицы к главному перекрестку шахристана сложился центральный ансамбль Бухары, формирующий ее неповторимый силуэт — Пои Калян (Пои Калян Комплекс), то есть "подножие Великого", подножие великого минарета Калян. Это историческое место. К югу от Арка традиционно, с 713 г., строились, рушились, восстанавливались после пожаров и войн, перемещаясь с места на место, здания главной соборной мечети города.

Большой интерес вызывают крепостные стены и ворота Бухары. Часть городской стены с огромными проломами – уникальный памятник оборонной архитектуры Узбекистана, важное звено исторической топографии города. Как сообщает автор «Истории Бухары» Наршахи (Х в.), первые стены шахристана были возведены еще в VIII веке, во время правления Тахиридов.

История ансамбля неразрывно связана с именем другого важного сановника Надира диван-беги (диван-беги - это название должности при ханском дворе). Надир диван-беги служил при Имам Кули-хане (1611-1642), наиболее сильном правителе династии Аштарханидов (Джанидов), пришедшей к власти в 1599 г. Аштарханиды были чужаками для могущественных феодалов на местах, близких к ушедшей со сцены правящей династии Шайбанидов. Поэтому Имам Кули-хан лишь частично удерживал власть в государстве. Кроме этого, приверженность традициям ислама у Аштарханидов была намного меньшей по сравнению с религиозной ревностностью Шайбанидов. Эти две важные особенности, свойственные времени правления Аштарханидов, вскоре проявились в знаменательной архитектурной тенденции.

Прямо у дороги, в степи Малик еще можно увидеть портал XII в., который вел некогда в Рабат-и Малик, "царский рабат" ("Рабат" - замок, крепость). Рабат был построен в XII в. на древней караванной дороге между Самаркандом и Бухарой. Источником водоснабжения для рабата служила сардоба Малик — гигантская, утопленная в землю кирпичная цистерна, перекрытая ступенчатым куполом. Сардоба заполняется водой из Заравшана по подземному каналу кяризу, имевшему выход на поверхность сетью колодцев. К воде от портала ведет спуск — пандус.

Средневековая Бухара — феномен искусства зодчих. XVI—XVII вв, особенно начало XVI в., были неспокойным временем неустойчивой власти первых ханов династии Шайбанидов и переноса столицы попеременно из Самарканда в Бухару.

Медресе Абд ал-Азиз-хана (1652) (Абдуллазиз-хана Медресе) составляет архитектурный ансамбль с Медресе Улугбека. Однако архитектурный декор этого здания несравненно более богатый по сравнению с декором Медресе Улугбека. Высокий портал медресе украшен богатым узором с использование флористической графики. В оформлении внутреннего двора и комнат использовался широкий набор приемов декоративного оформления, характерных для того времени: в том числе: резная и обливная керамика, кирпичная мозаика, резьба по мрамору, фрески из ганча и золочение.

На юге современного города расположена мечеть Намазгох. Считается, что на этом месте намазгох была сооружена еще в 9 веке в период правления Саманидов. Одной из характерных черт эпохи правления Саманидов является укрепление ислама. Благодаря этому столица государства Саманидов — Бухара превратилась в один из центров ислама на Востоке. Именно к тому времени относится и строительство первого духовного учебного заведения — медресе в Бухаре, была также построена соборная мечеть, ханаки — приюты для странствующих суфиев и, за чертой города, намазгох.